Ez az a 5 elem, ami amit ki bír tanulni egy Shinobi. Valameik 5 közül választani kell 1-et, hogy el lehessen kezdened az utad.

Fuuton (Szél elem): A Fuuton Ninjutsuk, támadó technikák. A környezetben fellelhető szelek erejét manipulálják, és képesek megvágni valakit, akár mint egy kard. Emiatt a tulajdonsága miatt alkalmas a Fuuton közel és távolsági harcokhoz. Elsődlegesen a Sunagakure Shinobikhoz társítják őket, akik rájöttek, hogyan lehet a Szél erejét fegyvereikre ruházni. A Fuuton erős a Raiton ellen, gyenge a Katon ellen.

Suiton (Víz elem): A Suiton Ninjutsuk a környezetben megtalálható vizet manipulálják. A Suiton nagyon hasznos a formai manipuláció gyakorlására, gyakorlatilag akármivé átalakítható, köszönhetően a víz folyékony állagának. Felöltheti egy fal, egy teremtmény vagy bármi más alakját is. Az egyik legelterjedtebb Chakra Elem típus. Általában a Kirigakure Shinobikhoz társítják őket. Gyakorisága miatt azonban elterjedt a világ sok pontján, mint például Takigakure és Amegakure. A Suiton gyenge a Doton ellen, de erősebb mint a Katon technikák.

Katon (Tűz elem): A Katon Ninjutsuk a környezetben lévő oxigénből merítenek energiát az égéshez. A belélegzett, majd a szájon át kilélegzett levegőt ezután meggyújtják, és szabadon eresztik a támadást. A Katon Jutsuk többnyire távolságiak, támadó technikák. A Katont elsődlegesen a Konohagakure Shinobikhoz társítják, közölük is a legkiemelkedőbben az Uchiha klán tagjai ismerték a Tűz Jutsukat. A Tora kézpecsét a Katon Ninjutsuk egyik általános jelzése. A Katon erős a Fuuton technikák ellen, de alulmarad a Suiton technikákkal szemben.

Doton (Föld elem): A Doton Ninjutsuk a környezetben fellelhető földet manipulálják. Az ilyen Elemű technikák általában támadó és védekező szerepet töltenek be. Akik a Doton kezeléséhez mesterien értenek, képesek megváltoztatni egy anyag állagát akár agyagra, sárra vagy fémesen keményre, lágyra, könnyen megmunkálhatóra. A Dotont az Iwagakure Shinobikhoz társítják. A Hebi kézpecsét a Doton Jutsuk általános jele. A Doton erősebb mint a Suiton, azonban gyengébb mint a Raiton.

Raiton (Villám elem): A Raiton Ninjutsuk a Chakrát elektromos energiává alakítják, és mivel a Chakrát láthatóvá teszi, ez a legchakraigényesebb Elem. A Raiton Ninjutsuk gyorsak, látványosak és halálosak. A Kumogakure Shinobikhoz szokták társítani őket. Erősebb a Doton Jutsuknál, de gyengébb a Fuuton Jutsuknál.